Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SIN3BO75182 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIN3BO75182 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms