Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NBNO60934 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBNO60934 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBNO60934 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBNO60934 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBNO60934 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBNO60934 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBNO60934 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBNO60934 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBNO60934 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBNO60934 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NBNO60934 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBNO60934 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBNO60934 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBNO60934 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBNO60934 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBNO60934 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBNO60934 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NBNO60934 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBNO60934 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBNO60934 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NBNO60934 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBNO60934 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBNO60934 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NBNO60934 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBNO60934 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBNO60934 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBNO60934 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBNO60934 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBNO60934 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NBNO60934 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBNO60934 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBNO60934 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBNO60934 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBNO60934 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NBNO60934 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBNO60934 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBNO60934 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBNO60934 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBNO60934 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBNO60934 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBNO60934 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBNO60934 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBNO60934 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBNO60934 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NBNO60934 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBNO60934 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NBNO60934 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBNO60934 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBNO60934 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBNO60934 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBNO60934 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBNO60934 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBNO60934 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBNO60934 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBNO60934 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBNO60934 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBNO60934 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBNO60934 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBNO60934 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBNO60934 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBNO60934 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBNO60934 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBNO60934 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBNO60934 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBNO60934 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBNO60934 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBNO60934 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBNO60934 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBNO60934 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBNO60934 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBNO60934 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBNO60934 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBNO60934 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NBNO60934 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBNO60934 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBNO60934 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBNO60934 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBNO60934 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBNO60934 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBNO60934 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NBNO60934 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBNO60934 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBNO60934 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBNO60934 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBNO60934 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBNO60934 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBNO60934 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NBNO60934 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBNO60934 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBNO60934 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBNO60934 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBNO60934 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBNO60934 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBNO60934 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBNO60934 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBNO60934 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBNO60934 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBNO60934 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBNO60934 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms