Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LANCL1O43813 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LANCL1O43813 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms