Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PTPRTO14522 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC30.7■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRTO14522 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC30.64■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRTO14522 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
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