Protein–RNA interactions for Protein: H7C0C1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0C1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H7C0C1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H7C0C1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H7C0C1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H7C0C1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H7C0C1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
H7C0C1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H7C0C1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H7C0C1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H7C0C1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H7C0C1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H7C0C1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H7C0C1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H7C0C1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H7C0C1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H7C0C1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H7C0C1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H7C0C1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
H7C0C1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H7C0C1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H7C0C1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H7C0C1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H7C0C1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H7C0C1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H7C0C1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H7C0C1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H7C0C1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H7C0C1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
H7C0C1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H7C0C1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H7C0C1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H7C0C1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H7C0C1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H7C0C1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H7C0C1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H7C0C1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H7C0C1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H7C0C1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H7C0C1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H7C0C1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H7C0C1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H7C0C1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H7C0C1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H7C0C1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H7C0C1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H7C0C1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H7C0C1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H7C0C1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H7C0C1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H7C0C1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H7C0C1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H7C0C1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H7C0C1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H7C0C1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H7C0C1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H7C0C1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
H7C0C1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H7C0C1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H7C0C1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H7C0C1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H7C0C1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H7C0C1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H7C0C1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H7C0C1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H7C0C1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H7C0C1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H7C0C1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H7C0C1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
H7C0C1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H7C0C1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H7C0C1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H7C0C1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H7C0C1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
H7C0C1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H7C0C1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H7C0C1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H7C0C1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H7C0C1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H7C0C1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H7C0C1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H7C0C1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H7C0C1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H7C0C1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H7C0C1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H7C0C1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H7C0C1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H7C0C1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H7C0C1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H7C0C1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H7C0C1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H7C0C1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H7C0C1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H7C0C1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H7C0C1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H7C0C1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H7C0C1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
H7C0C1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
H7C0C1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H7C0C1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
H7C0C1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms