Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PMD0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PMD0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PMD0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PMD0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
E9PMD0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
E9PMD0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E9PMD0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E9PMD0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
E9PMD0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E9PMD0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
E9PMD0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
E9PMD0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E9PMD0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E9PMD0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E9PMD0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E9PMD0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E9PMD0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E9PMD0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
E9PMD0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
E9PMD0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PMD0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PMD0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PMD0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PMD0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PMD0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PMD0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PMD0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PMD0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PMD0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PMD0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PMD0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PMD0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PMD0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PMD0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PMD0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PMD0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PMD0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PMD0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PMD0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PMD0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PMD0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PMD0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PMD0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PMD0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PMD0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PMD0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PMD0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PMD0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PMD0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E9PMD0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E9PMD0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E9PMD0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E9PMD0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E9PMD0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E9PMD0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E9PMD0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
E9PMD0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E9PMD0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
E9PMD0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E9PMD0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E9PMD0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E9PMD0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
E9PMD0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E9PMD0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E9PMD0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E9PMD0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
E9PMD0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
E9PMD0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
E9PMD0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E9PMD0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E9PMD0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
E9PMD0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E9PMD0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
E9PMD0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E9PMD0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PMD0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PMD0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PMD0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PMD0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PMD0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PMD0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PMD0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PMD0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PMD0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PMD0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PMD0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PMD0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PMD0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E9PMD0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E9PMD0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E9PMD0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E9PMD0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
E9PMD0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
E9PMD0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
E9PMD0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E9PMD0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E9PMD0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E9PMD0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E9PMD0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms