Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms