Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LCHNA4D1U4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LCHNA4D1U4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LCHNA4D1U4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LCHNA4D1U4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCHNA4D1U4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCHNA4D1U4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCHNA4D1U4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCHNA4D1U4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCHNA4D1U4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCHNA4D1U4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LCHNA4D1U4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCHNA4D1U4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCHNA4D1U4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCHNA4D1U4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCHNA4D1U4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCHNA4D1U4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCHNA4D1U4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCHNA4D1U4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCHNA4D1U4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCHNA4D1U4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCHNA4D1U4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCHNA4D1U4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCHNA4D1U4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCHNA4D1U4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LCHNA4D1U4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCHNA4D1U4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCHNA4D1U4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCHNA4D1U4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCHNA4D1U4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCHNA4D1U4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCHNA4D1U4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCHNA4D1U4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCHNA4D1U4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCHNA4D1U4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCHNA4D1U4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCHNA4D1U4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCHNA4D1U4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCHNA4D1U4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCHNA4D1U4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCHNA4D1U4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCHNA4D1U4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCHNA4D1U4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCHNA4D1U4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCHNA4D1U4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCHNA4D1U4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCHNA4D1U4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LCHNA4D1U4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LCHNA4D1U4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms