Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X2

PIAS3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIAS3Q9Y6X2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PIAS3Q9Y6X2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIAS3Q9Y6X2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIAS3Q9Y6X2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIAS3Q9Y6X2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIAS3Q9Y6X2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIAS3Q9Y6X2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIAS3Q9Y6X2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIAS3Q9Y6X2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIAS3Q9Y6X2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIAS3Q9Y6X2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms