Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARFGEF1Q9Y6D6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms