Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL4A3BPQ9Y5P4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL4A3BPQ9Y5P4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms