Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHB12Q9Y5F1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB12Q9Y5F1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms