Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4Y9

LSM5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM5Q9Y4Y9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LSM5Q9Y4Y9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms