Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRG3Q9Y2Y8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms