Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FARSAQ9Y285 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FARSAQ9Y285 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FARSAQ9Y285 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FARSAQ9Y285 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FARSAQ9Y285 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FARSAQ9Y285 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FARSAQ9Y285 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FARSAQ9Y285 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
FARSAQ9Y285 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FARSAQ9Y285 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FARSAQ9Y285 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FARSAQ9Y285 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FARSAQ9Y285 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FARSAQ9Y285 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FARSAQ9Y285 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FARSAQ9Y285 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FARSAQ9Y285 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FARSAQ9Y285 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FARSAQ9Y285 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FARSAQ9Y285 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FARSAQ9Y285 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FARSAQ9Y285 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FARSAQ9Y285 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FARSAQ9Y285 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FARSAQ9Y285 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FARSAQ9Y285 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FARSAQ9Y285 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FARSAQ9Y285 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FARSAQ9Y285 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FARSAQ9Y285 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FARSAQ9Y285 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FARSAQ9Y285 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FARSAQ9Y285 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FARSAQ9Y285 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FARSAQ9Y285 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FARSAQ9Y285 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FARSAQ9Y285 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms