Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ6

THSD7A, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7AQ9UPZ6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
THSD7AQ9UPZ6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
THSD7AQ9UPZ6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
THSD7AQ9UPZ6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
THSD7AQ9UPZ6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
THSD7AQ9UPZ6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
THSD7AQ9UPZ6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
THSD7AQ9UPZ6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
THSD7AQ9UPZ6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
THSD7AQ9UPZ6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
THSD7AQ9UPZ6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
THSD7AQ9UPZ6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
THSD7AQ9UPZ6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
THSD7AQ9UPZ6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
THSD7AQ9UPZ6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
THSD7AQ9UPZ6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
THSD7AQ9UPZ6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
THSD7AQ9UPZ6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
THSD7AQ9UPZ6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
THSD7AQ9UPZ6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
THSD7AQ9UPZ6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
THSD7AQ9UPZ6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
THSD7AQ9UPZ6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
THSD7AQ9UPZ6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
THSD7AQ9UPZ6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
THSD7AQ9UPZ6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
THSD7AQ9UPZ6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
THSD7AQ9UPZ6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
THSD7AQ9UPZ6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
THSD7AQ9UPZ6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
THSD7AQ9UPZ6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
THSD7AQ9UPZ6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.56■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.54■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.53■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.53■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.52■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
THSD7AQ9UPZ6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms