Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
AGTPBP1Q9UPW5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGTPBP1Q9UPW5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms