Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX12Q9UMY4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms