Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL62

TRPC5, Short transient receptor potential channel 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC5Q9UL62 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRPC5Q9UL62 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRPC5Q9UL62 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TRPC5Q9UL62 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRPC5Q9UL62 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRPC5Q9UL62 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRPC5Q9UL62 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRPC5Q9UL62 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRPC5Q9UL62 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRPC5Q9UL62 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRPC5Q9UL62 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRPC5Q9UL62 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRPC5Q9UL62 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRPC5Q9UL62 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRPC5Q9UL62 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRPC5Q9UL62 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRPC5Q9UL62 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRPC5Q9UL62 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRPC5Q9UL62 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRPC5Q9UL62 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRPC5Q9UL62 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRPC5Q9UL62 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TRPC5Q9UL62 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRPC5Q9UL62 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRPC5Q9UL62 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRPC5Q9UL62 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TRPC5Q9UL62 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRPC5Q9UL62 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRPC5Q9UL62 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRPC5Q9UL62 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRPC5Q9UL62 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRPC5Q9UL62 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRPC5Q9UL62 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRPC5Q9UL62 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRPC5Q9UL62 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TRPC5Q9UL62 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRPC5Q9UL62 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRPC5Q9UL62 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRPC5Q9UL62 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRPC5Q9UL62 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRPC5Q9UL62 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRPC5Q9UL62 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRPC5Q9UL62 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRPC5Q9UL62 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRPC5Q9UL62 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRPC5Q9UL62 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRPC5Q9UL62 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRPC5Q9UL62 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRPC5Q9UL62 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRPC5Q9UL62 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRPC5Q9UL62 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRPC5Q9UL62 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRPC5Q9UL62 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRPC5Q9UL62 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRPC5Q9UL62 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRPC5Q9UL62 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRPC5Q9UL62 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRPC5Q9UL62 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRPC5Q9UL62 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRPC5Q9UL62 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRPC5Q9UL62 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRPC5Q9UL62 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRPC5Q9UL62 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRPC5Q9UL62 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRPC5Q9UL62 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRPC5Q9UL62 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRPC5Q9UL62 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRPC5Q9UL62 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRPC5Q9UL62 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRPC5Q9UL62 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRPC5Q9UL62 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRPC5Q9UL62 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRPC5Q9UL62 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRPC5Q9UL62 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRPC5Q9UL62 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRPC5Q9UL62 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRPC5Q9UL62 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRPC5Q9UL62 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRPC5Q9UL62 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRPC5Q9UL62 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRPC5Q9UL62 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRPC5Q9UL62 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRPC5Q9UL62 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRPC5Q9UL62 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRPC5Q9UL62 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRPC5Q9UL62 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRPC5Q9UL62 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRPC5Q9UL62 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRPC5Q9UL62 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRPC5Q9UL62 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRPC5Q9UL62 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRPC5Q9UL62 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRPC5Q9UL62 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRPC5Q9UL62 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRPC5Q9UL62 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRPC5Q9UL62 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRPC5Q9UL62 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRPC5Q9UL62 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRPC5Q9UL62 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRPC5Q9UL62 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms