Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MBD1Q9UIS9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms