Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SFMBT1Q9UHJ3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms