Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCF20Q9UGU0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms