Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLIP2Q9UDT6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms