Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
DKK3Q9UBP4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms