Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMOD3Q9NYL9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMOD3Q9NYL9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms