Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DLL3Q9NYJ7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DLL3Q9NYJ7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms