Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms