Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL11Q9NVR0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL11Q9NVR0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL11Q9NVR0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL11Q9NVR0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL11Q9NVR0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL11Q9NVR0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL11Q9NVR0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL11Q9NVR0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL11Q9NVR0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL11Q9NVR0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL11Q9NVR0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL11Q9NVR0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL11Q9NVR0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL11Q9NVR0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms