Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP1

DDX18, ATP-dependent RNA helicase DDX18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX18Q9NVP1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDX18Q9NVP1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDX18Q9NVP1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDX18Q9NVP1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDX18Q9NVP1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDX18Q9NVP1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDX18Q9NVP1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDX18Q9NVP1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDX18Q9NVP1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDX18Q9NVP1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDX18Q9NVP1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDX18Q9NVP1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDX18Q9NVP1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDX18Q9NVP1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDX18Q9NVP1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDX18Q9NVP1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDX18Q9NVP1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDX18Q9NVP1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDX18Q9NVP1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDX18Q9NVP1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDX18Q9NVP1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDX18Q9NVP1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDX18Q9NVP1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDX18Q9NVP1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDX18Q9NVP1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDX18Q9NVP1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDX18Q9NVP1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDX18Q9NVP1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDX18Q9NVP1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDX18Q9NVP1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDX18Q9NVP1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DDX18Q9NVP1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDX18Q9NVP1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDX18Q9NVP1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDX18Q9NVP1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDX18Q9NVP1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDX18Q9NVP1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDX18Q9NVP1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDX18Q9NVP1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDX18Q9NVP1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDX18Q9NVP1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDX18Q9NVP1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDX18Q9NVP1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDX18Q9NVP1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDX18Q9NVP1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDX18Q9NVP1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDX18Q9NVP1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDX18Q9NVP1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DDX18Q9NVP1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms