Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms