Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms