Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms