Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR96

TLR9, Toll-like receptor 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR9Q9NR96 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TLR9Q9NR96 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms