Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR16

CD163L1, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M160, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163L1Q9NR16 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CD163L1Q9NR16 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
CD163L1Q9NR16 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CD163L1Q9NR16 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CD163L1Q9NR16 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CD163L1Q9NR16 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CD163L1Q9NR16 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CD163L1Q9NR16 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CD163L1Q9NR16 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CD163L1Q9NR16 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CD163L1Q9NR16 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CD163L1Q9NR16 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CD163L1Q9NR16 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CD163L1Q9NR16 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CD163L1Q9NR16 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CD163L1Q9NR16 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CD163L1Q9NR16 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CD163L1Q9NR16 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CD163L1Q9NR16 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CD163L1Q9NR16 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CD163L1Q9NR16 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CD163L1Q9NR16 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CD163L1Q9NR16 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CD163L1Q9NR16 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CD163L1Q9NR16 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CD163L1Q9NR16 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CD163L1Q9NR16 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CD163L1Q9NR16 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CD163L1Q9NR16 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CD163L1Q9NR16 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CD163L1Q9NR16 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CD163L1Q9NR16 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CD163L1Q9NR16 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CD163L1Q9NR16 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CD163L1Q9NR16 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CD163L1Q9NR16 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CD163L1Q9NR16 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CD163L1Q9NR16 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CD163L1Q9NR16 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CD163L1Q9NR16 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CD163L1Q9NR16 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CD163L1Q9NR16 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CD163L1Q9NR16 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CD163L1Q9NR16 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CD163L1Q9NR16 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CD163L1Q9NR16 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CD163L1Q9NR16 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms