Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCG8

CWC22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC22Q9HCG8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CWC22Q9HCG8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CWC22Q9HCG8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CWC22Q9HCG8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CWC22Q9HCG8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CWC22Q9HCG8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CWC22Q9HCG8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CWC22Q9HCG8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CWC22Q9HCG8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CWC22Q9HCG8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CWC22Q9HCG8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CWC22Q9HCG8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CWC22Q9HCG8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CWC22Q9HCG8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CWC22Q9HCG8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CWC22Q9HCG8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CWC22Q9HCG8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CWC22Q9HCG8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CWC22Q9HCG8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CWC22Q9HCG8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CWC22Q9HCG8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CWC22Q9HCG8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CWC22Q9HCG8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CWC22Q9HCG8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CWC22Q9HCG8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CWC22Q9HCG8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CWC22Q9HCG8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CWC22Q9HCG8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CWC22Q9HCG8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CWC22Q9HCG8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CWC22Q9HCG8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CWC22Q9HCG8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CWC22Q9HCG8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CWC22Q9HCG8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CWC22Q9HCG8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms