Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY50

SEC11C, Signal peptidase complex catalytic subunit SEC11C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC11CQ9BY50 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC11CQ9BY50 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEC11CQ9BY50 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEC11CQ9BY50 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEC11CQ9BY50 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEC11CQ9BY50 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEC11CQ9BY50 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEC11CQ9BY50 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEC11CQ9BY50 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEC11CQ9BY50 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC11CQ9BY50 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC11CQ9BY50 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC11CQ9BY50 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC11CQ9BY50 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC11CQ9BY50 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC11CQ9BY50 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC11CQ9BY50 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC11CQ9BY50 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC11CQ9BY50 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC11CQ9BY50 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC11CQ9BY50 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC11CQ9BY50 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC11CQ9BY50 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC11CQ9BY50 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC11CQ9BY50 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC11CQ9BY50 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC11CQ9BY50 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC11CQ9BY50 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC11CQ9BY50 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC11CQ9BY50 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC11CQ9BY50 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEC11CQ9BY50 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEC11CQ9BY50 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEC11CQ9BY50 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEC11CQ9BY50 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEC11CQ9BY50 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEC11CQ9BY50 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEC11CQ9BY50 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms