Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIPSNAP3BQ9BS92 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms