Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TXNDC17Q9BRA2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TXNDC17Q9BRA2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TXNDC17Q9BRA2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TXNDC17Q9BRA2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TXNDC17Q9BRA2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms