Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SGIP1Q9BQI5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SGIP1Q9BQI5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms