Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ04

RBM4B, RNA-binding protein 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4BQ9BQ04 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms