Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MEIS3Q99687 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MEIS3Q99687 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms