Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHP1Q99653 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHP1Q99653 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms