Protein–RNA interactions for Protein: Q99626

CDX2, Homeobox protein CDX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDX2Q99626 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDX2Q99626 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDX2Q99626 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CDX2Q99626 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CDX2Q99626 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CDX2Q99626 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDX2Q99626 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDX2Q99626 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDX2Q99626 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDX2Q99626 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDX2Q99626 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDX2Q99626 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDX2Q99626 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CDX2Q99626 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CDX2Q99626 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDX2Q99626 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDX2Q99626 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDX2Q99626 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDX2Q99626 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDX2Q99626 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms