Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUDCD1Q96RS6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms