Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ALS2CR12Q96Q35 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms