Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR6

CFAP57, Cilia- and flagella-associated protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP57Q96MR6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP57Q96MR6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms