Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZBED3Q96IU2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZBED3Q96IU2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZBED3Q96IU2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZBED3Q96IU2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZBED3Q96IU2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZBED3Q96IU2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZBED3Q96IU2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZBED3Q96IU2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZBED3Q96IU2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZBED3Q96IU2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZBED3Q96IU2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED3Q96IU2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED3Q96IU2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED3Q96IU2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED3Q96IU2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED3Q96IU2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED3Q96IU2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED3Q96IU2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED3Q96IU2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED3Q96IU2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED3Q96IU2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED3Q96IU2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED3Q96IU2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED3Q96IU2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED3Q96IU2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED3Q96IU2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED3Q96IU2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED3Q96IU2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED3Q96IU2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED3Q96IU2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED3Q96IU2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZBED3Q96IU2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZBED3Q96IU2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZBED3Q96IU2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZBED3Q96IU2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZBED3Q96IU2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZBED3Q96IU2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZBED3Q96IU2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZBED3Q96IU2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZBED3Q96IU2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZBED3Q96IU2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZBED3Q96IU2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZBED3Q96IU2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZBED3Q96IU2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZBED3Q96IU2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZBED3Q96IU2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZBED3Q96IU2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZBED3Q96IU2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZBED3Q96IU2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZBED3Q96IU2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZBED3Q96IU2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZBED3Q96IU2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
ZBED3Q96IU2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ZBED3Q96IU2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZBED3Q96IU2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZBED3Q96IU2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZBED3Q96IU2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZBED3Q96IU2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZBED3Q96IU2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZBED3Q96IU2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZBED3Q96IU2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZBED3Q96IU2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZBED3Q96IU2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ZBED3Q96IU2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZBED3Q96IU2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZBED3Q96IU2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZBED3Q96IU2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZBED3Q96IU2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZBED3Q96IU2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZBED3Q96IU2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZBED3Q96IU2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ZBED3Q96IU2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZBED3Q96IU2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZBED3Q96IU2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ZBED3Q96IU2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZBED3Q96IU2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZBED3Q96IU2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZBED3Q96IU2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED3Q96IU2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED3Q96IU2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED3Q96IU2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED3Q96IU2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED3Q96IU2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED3Q96IU2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED3Q96IU2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED3Q96IU2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED3Q96IU2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED3Q96IU2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED3Q96IU2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED3Q96IU2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED3Q96IU2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED3Q96IU2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED3Q96IU2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED3Q96IU2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED3Q96IU2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZBED3Q96IU2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ZBED3Q96IU2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZBED3Q96IU2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ZBED3Q96IU2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
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