Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDC3Q96F86 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms