Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CMTM5Q96DZ9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CMTM5Q96DZ9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CMTM5Q96DZ9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CMTM5Q96DZ9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CMTM5Q96DZ9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CMTM5Q96DZ9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CMTM5Q96DZ9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CMTM5Q96DZ9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CMTM5Q96DZ9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CMTM5Q96DZ9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CMTM5Q96DZ9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CMTM5Q96DZ9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CMTM5Q96DZ9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CMTM5Q96DZ9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CMTM5Q96DZ9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CMTM5Q96DZ9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CMTM5Q96DZ9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CMTM5Q96DZ9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CMTM5Q96DZ9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CMTM5Q96DZ9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CMTM5Q96DZ9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CMTM5Q96DZ9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CMTM5Q96DZ9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CMTM5Q96DZ9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CMTM5Q96DZ9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMTM5Q96DZ9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms