Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HDAC11Q96DB2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC11Q96DB2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms